La estructura central de CAPES está conformada por su Directora, su Subdirector o Director Adjunto, su Gerente General, y su Comité Consultivo, quienes en conjunto componen el Directorio del centro. A ellos se suma un Comité Científico integrado por los investigadores principales de sus 7 líneas de investigación. Estos son sus nombres.
Dra. Rosanna Ginocchio C.
Directora | Correo: rginocch@uc.cl
Como directora de CAPES, la Dra. Ginocchio se encarga de liderar, coordinar y administrar la estrategia y quehacer general del Centro, en aras a asegurar y facilitar su correcta ejecución en todos sus niveles.
Dr. Enrico Rezende L.
Subdirector | Correo: enrico.rezende@gmail.com
Como subdirector y director adjunto, el Dr. Rezende colabora en la coordinación general del Centro, además de supervisar sus aspectos ejecutivos. Subroga asimismo a su Directora en su ausencia.
Víctor Valdivia D., MBA
Gerente General | Correo: vvaldivia@bio.puc.cl
Asiste al Director en el diseño y ejecución del presupuesto del Centro, así como en sus operaciones diarias.
Comité científico
Dra. Rosanna Ginocchio C.
Correo: rginocch@uc.cl
Investigadora principal Línea 1: Soluciones basadas en la naturaleza para la recuperación de ecosistemas degradados por el ser humano bajo el cambio climático
Dra. María Josefina Poupin S.
Correo: mpoupin@uai.cl
Investigadora principal Línea 2: Aproximaciones desde la bioingeniería para la protección del medio ambiente y las tecnologías sostenibles
Dr. Enrico Rezende L.
Correo: enrico.rezende@gmail.com
Investigador principal Línea 3: Fisiología y ecología del cambio global
Dr. Mauricio Lima A.
Correo: mlima@bio.puc.cl
Investigador principal Línea 4: Teoría poblacional aplicada a la predicción de dinámicas de sistemas socioecológicos
Dr. Stefan Gelcich C.
Correo: sgelcich@bio.puc.cl
Investigador principal Línea 5: Gestión de recursos naturales sostenibles e investigación en política pública
Dr. Eduardo Arellano O.
Correo: eduardoarellano@uc.cl
Investigador principal Línea 6: Intensificación ecológica para una agricultura sostenible
Dr. Felipe Vásquez L.
Correo: fvlavin@gmail.com
Investigador principal Línea 7: Servicios ecosistémicos y comportamiento humano
Comité asesor
El Comité Asesor CAPES está compuesto por profesionales externos de diferentes instituciones públicas, privadas y de ONGs que aportan su experiencia, asesoramiento estratégico y orientación durante la gestión del centro. Las y los miembros del Comité Asesor participan en las reuniones anuales e intercambian información y prestan asistencia a su directora de forma periódica.
Actualmente lo componen:
| María Angélica Fellenberg | Universidad Católica de Chile | Vicerrectora de Investigación |
| Rosa Roa | Centro de Innovación y Tecnología de Concha y Toro | Investigadora |
| Álvaro Palma | Fisioaqua EIRL | Gerente General |
| Rafael Ascanio | AngloAmerican Chile | Asesor de Biodiversidad de la Gerencia de Carbono Neutralidad y Biodiversidad |
| Miguel Ángel Díaz | Corporación Nacional Forestal | Analista Conservación de Diversidad Biológica |
| Juan José Donoso | The Nature Conservancy – TNC Chile | Director |