La estructura central de CAPES está conformada por su Director, su Subdirector o Director Adjunto, su Gerente General, y su Comité Consultivo, quienes en conjunto componen el Directorio del centro. A ellos se suma un Comité Científico integrado por los investigadores principales de sus 7 líneas de investigación. Estos son sus nombres.
Dr. Fabian Jaksic A.
Director | Correo: fjaksic@bio.puc.cl
Como director de CAPES, el Dr. Jaksic se encarga de liderar, coordinar y administrar la estrategia y quehacer general del Centro, en aras a asegurar y facilitar su correcta ejecución en todos sus niveles.
Dra. Rosanna Ginocchio C.
Subdirectora | Correo: rginocch@uc.cl
Como subdirectora y directora adjunta, la Dra. Ginocchio colabora en la coordinación general del Centro, además de supervisar sus aspectos ejecutivos. Subroga asimismo a su Director en su ausencia.
Víctor Valdivia D., MBA
Gerente General | Correo: vvaldivia@bio.puc.cl
Asiste al Director en el diseño y ejecución del presupuesto del Centro, así como en sus operaciones diarias.
Comité científico
Dra. Rosanna Ginocchio C.
Correo: rginocch@uc.cl
Investigadora principal Línea 1: Impactos ambientales de metales y rehabilitación de suelos.
Dr. Bernardo González O.
Correo: bernardo.gonzalez@uai.cl
Investigador principal Línea 2: Bioingeniería aplicada al medio ambiente y la sustentabilidad
Dr. Enrico Rezende L.
Correo: enrico.rezende@gmail.com
Investigador principal Línea 3: Fisiología del cambio global
Dr. Mauricio Lima A.
Correo: mlima@bio.puc.cl
Investigador principal Línea 4: Dinámicas de población y cambio global
Dr. Stefan Gelcich C.
Correo: sgelcich@bio.puc.cl
Investigador principal Línea 5: Gestión sustentable de los recursos naturales
Dr. Eduardo Arellano O.
Correo: eduardoarellano@uc.cl
Investigador principal Línea 6: Intensificación ecológica y agricultura sustentable
Dr. Felipe Vásquez L.
Correo: fvlavin@gmail.com
Investigador principal Línea 7: Servicios ecosistémicos y comportamiento humano
Comité consultivo
| Pedro Bouchon Aguirre | Pontificia Universidad Católica de Chile | Vicerrector de Investigación |
| Carlos Gajardo | Sociedad Nacional de Minería de Chile | Gerente de Medio Ambiente |
| Álvaro Palma | Fisioaqua EIRL | Gerente General |
| Agustín Iriarte | Flora & Fauna Ltda. | Gerente General |
| Miguel Díaz Gacitúa | Corporación Nacional Forestal – CONAF | Analista Conservación de Diversidad Biológica |
| María Francisca Tondreau | The Nature Conservancy – TNC Chile | Directora |